Ngày 07 tháng 9 năm 2000 Thủ tướng Chính phủ đã ký quyết định số 850/QĐ-TTg về việc phê duyệt Đề án xây dựng các phòng thí nghiệm trọng điểm quốc gia (văn bản kèm theo). Theo Quyết định này, các phòng thí nghiệm thuộc lĩnh vực công nghệ sinh học được xây dựng bao gồm: PTN Công nghệ gene; PTN Công nghệ enzym và protein; PTN Công nghệ vắc-xin và các chế phẩm y sinh học; PTN Công nghệ tế bào động vật; PTN Công nghệ tế bào thực vật . Tiếp theo quyết định trên, Bộ Khoa học công nghệ và môi trường cũ (nay là Bộ Khoa học và Công nghệ) với tư cách là cơ quan chủ trì thực hiện Quyết định trên đã có Quyết định số 2002/QĐ-BKHCNMT ngày 31 tháng 01 năm 2002 về việc ban hành Quy chế tạm thời về tổ chức và hoạt động của phòng thí nghiệm trọng điểm (văn bản kèm theo). Đến nay, sau khi kết thúc giai đoạn 1 (2000 - 2005), các phòng thí nghiệm trọng điểm đã được xây dựng và đi vào hoạt động. Thông tin về các phòng thí nghiệm trọng điểm:
Phòng thí nghiệm trọng điểm công nghệ gen.
Phòng thí nghiệm trọng điểm công nghệ tế bào động vật.
Phòng thí nghiệm trọng điểm phía Bắc về Công nghệ tế bào thực vật.
Phòng thí nghiệm trọng điểm phía Nam về Công nghệ tế bào thực vật.
Phòng thí nghiệm trọng điểm công nghệ enzym-protein.